je hlavním sídlem vyšší nervové činnosti. Řada jejích základních programů je geneticky zakotvena a fixována. Ostatní vznikají postupně vývojem a zráním organismu. Jakým způsobem není dosud přesně známo. Pavlov vysvětloval tento proces pevnou vazbou dvou zcela odlišných podnětů v časové souvislosti a za bdění organismu - podmíněný reflex. Vznik a pevnost spojů je různá a individuální. V koře mozkové se během individuálního vývoje vytvoří množství podmíněných reflexů. Některé zanikají, vznikají však další, což opět souvisí s vývojem individua. Utvářejí se asociace, což je vzájemná vazba dvou neúčinných podnětů, takže nejsou splněny podmínky podmíněného reflexu. Kromě uvedených se vytvářejí ještě další vazby (habituace, percepce, reiterace, impregnace atd.), které společně utvářejí složitý mechanismus činnosti, jak se pak prakticky projevuje. Výsledkem je motivace k činnosti (z projekcí zrakových, sluchových, vzpomínky, obranné reakce apod.), cílená činnost, obratnost, individualita pohybových automatismů atd.